Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OC90Q02509 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms