Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms