Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms