Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms