Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms