Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms