Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAP1AP62834 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms