Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms