Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB25P57735 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB25P57735 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB25P57735 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms