Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK4P57078 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms