Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms