Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN15P56746 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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