Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms