Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP9P55211 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP9P55211 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms