Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX2P52951 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms