Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX2P50458 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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