Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF6P49848 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF6P49848 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms