Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP9P49458 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms