Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms