Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms