Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms