Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD79BP40259 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms