Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms