Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA5P31644 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms