Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms