Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMBRP28336 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMBRP28336 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms