Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX2P28328 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms