Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms