Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms