Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms