Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DMDP11532 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DMDP11532 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DMDP11532 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms