Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHGAP10645 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CHGAP10645 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHGAP10645 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHGAP10645 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHGAP10645 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms