Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM228BP0C875 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM228BP0C875 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms