Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47B1P0C2W7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms