Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RHOP08100 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RHOP08100 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RHOP08100 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOP08100 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOP08100 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms