Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms