Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms