Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN1O60240 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN1O60240 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms