Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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