Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms