Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGTAO43765 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGTAO43765 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms