Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDB2O43679 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDB2O43679 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDB2O43679 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LDB2O43679 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms