Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF13O43567 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF13O43567 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms