Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms