Protein–RNA interactions for Protein: C9JG80

NPIPB4, Nuclear pore complex-interacting protein family member B4, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4C9JG80 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB4C9JG80 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms