Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00587B1AMM8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms