Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WASHC1A8K0Z3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms