Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms