Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms