Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms